jaguar

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru / Биоинформатики Санкт-Петербургского госуниверситета создали новый алгоритм для анализа метагеномов — наборов геномов больших сообществ микроорганизмов. Такие организмы, например, обитают в почве, воде, а также в кишечниках животных и человека. Новый подход позволил выяснить, что в настоящее время медики знают лишь о половине кишечных бактерий, которые живут в организмах людей. Результаты исследования уже опубликованы в журнале Cell Systems.

Биоинформатики восстанавливают последовательность генома, так как в нем заложены данные о наследственных особенностях живого организма. Для выявления информации специалисты секвенируют («разрезают» молекулы ДНК на мелкие «кусочки», а затем прочитывают каждый из них). Затем геном восстанавливают (собирают) из фрагментов, называемых ридами.

В настоящее время ученые умеют работать как с единственным геномом, так и с их совокупностями, называемыми метагеномами. Это может быть генетический материал большого сообщества бактерий, которое живет в почве, в воде океанов, в сточных водах, а также в кишечнике человека. Новый алгоритм, который разработали младший научный сотрудник СПбГУ Антон Банкевич и завлабораторией «Центр алгоритмической биотехнологии» Института трансляционной биомедицины СПбГУ Павел Певзнер, позволяет гораздо эффективнее исследовать именно такой генетический материал.

Исследователи СПбГУ первыми в мире начали изучать редкие бактерии с помощью анализа результатов секвенирования сразу двух технологий: Illumina, для получения коротких фрагментов ДНК, и TruSeq Synthetic Long Reads (TSLR) для восстановления длинных участков генома. Биоинформатики с помощью различных математических методов находят участки ДНК (как короткие, так и длинные).

Антон Банкевич сообщил, что расчеты показали - суммарная длина геномов бактерий в кишечнике человека равна 1,3 миллиарда нуклеотидов, а исследователи восстановили лишь только 656 миллионов. Вывод - ученые знают только половину микроорганизмов, которые живут в кишечнике (животе) человека. Он также отметил, что новые бактерии могут обладать интересными свойствами и помогут создавать новые виды антибиотиков, пестицидов, помочь создать устойчивые к болезням овощей и фруктов. Исследования помогут выявить различные заболеваниях желудочно-кишечного тракта.
фото: архив logicno.com

Добавляйте наше издание, нажав на "Мои источники", и вы всегда будете видеть свежие новости от Absolut TV в сервисе Яндекс Новости и в Google News Подписывайтесь на канал ABSOLUT TV Дзен Яндекс
Фотогалерея
Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий
BMW
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

18:55
Преданная страна. К 30-летию уничтожения СССР. Вячеслав Шведиков
17:29
РНИМУ им. Н.И. Пирогова проведёт олимпиаду по химии и биологии
21:53
Многонациональный спортивный онлайн-фестиваль "В ГТО мы едины" состоялся в Кузбассе
13:28
РХТУ показал сверхстабильную оптическую память на международной выставке «Химия 2020»
11:54
Республика Удмуртия стала участником проекта национального бренда «Сделано в России»
21:37
Путин: передача Азербайджану семи районов, занятых Арменией, возможна
10:38
Женский деловой альянс БРИКС усиливает роль участия женщин в экономике стран
19:07
Дина Аверина лидирует в многоборье на международном онлайн-турнире по гимнастике
18:35
Бесплатными лекарствами обеспечат амбулаторных пациентов с COVID-19
13:32
Володин упрекнул Силуанова за то, что он не слышит запросы граждан и депутатов
обновлено
12:27
Рейд инспекции на закрытую свалку закончился четырьмя штрафами за ввоз мусора
16:35
Правительство РФ продлило программу льготной ипотеки под 6,5%
15:42
Аллея памяти погибших медиков была создана в саду «Прометей» сегодня в Петербурге
14:44
Роспотребнадзор ввёл всеобщий масочный режим по всей России
16:27
iPhone 12 и 12 Pro раскупают быстро в России. Первую партию продали за три дня
15:41
Штаб Минобороны уходит на капитальный ремонт
13:37
"Ротор" заявил претензии в РФС по судейству матча с "Локомотивом"
13:04
Десятки российских депутатов заразились коронавирусом, заявил Володин
14:51
СК возбудил дело по заказному убийству депутата Петрова, отца пилота «Формулы-1» Виталия Петрова
19:14
"Зенит" проиграл на своем поле "Рубину" в РПЛ
Больше новостей
Новая охта