Jaguar

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru / Биоинформатики Санкт-Петербургского госуниверситета создали новый алгоритм для анализа метагеномов — наборов геномов больших сообществ микроорганизмов. Такие организмы, например, обитают в почве, воде, а также в кишечниках животных и человека. Новый подход позволил выяснить, что в настоящее время медики знают лишь о половине кишечных бактерий, которые живут в организмах людей. Результаты исследования уже опубликованы в журнале Cell Systems.

Биоинформатики восстанавливают последовательность генома, так как в нем заложены данные о наследственных особенностях живого организма. Для выявления информации специалисты секвенируют («разрезают» молекулы ДНК на мелкие «кусочки», а затем прочитывают каждый из них). Затем геном восстанавливают (собирают) из фрагментов, называемых ридами.

В настоящее время ученые умеют работать как с единственным геномом, так и с их совокупностями, называемыми метагеномами. Это может быть генетический материал большого сообщества бактерий, которое живет в почве, в воде океанов, в сточных водах, а также в кишечнике человека. Новый алгоритм, который разработали младший научный сотрудник СПбГУ Антон Банкевич и завлабораторией «Центр алгоритмической биотехнологии» Института трансляционной биомедицины СПбГУ Павел Певзнер, позволяет гораздо эффективнее исследовать именно такой генетический материал.

Исследователи СПбГУ первыми в мире начали изучать редкие бактерии с помощью анализа результатов секвенирования сразу двух технологий: Illumina, для получения коротких фрагментов ДНК, и TruSeq Synthetic Long Reads (TSLR) для восстановления длинных участков генома. Биоинформатики с помощью различных математических методов находят участки ДНК (как короткие, так и длинные).

Антон Банкевич сообщил, что расчеты показали - суммарная длина геномов бактерий в кишечнике человека равна 1,3 миллиарда нуклеотидов, а исследователи восстановили лишь только 656 миллионов. Вывод - ученые знают только половину микроорганизмов, которые живут в кишечнике (животе) человека. Он также отметил, что новые бактерии могут обладать интересными свойствами и помогут создавать новые виды антибиотиков, пестицидов, помочь создать устойчивые к болезням овощей и фруктов. Исследования помогут выявить различные заболеваниях желудочно-кишечного тракта.
фото: архив logicno.com

Добавляйте наше издание, нажав на "Мои источники", и вы всегда будете видеть свежие новости от Absolut TV в сервисе Яндекс Новости и в Google News Подписывайтесь на канал ABSOLUT TV Дзен Яндекс
Фотогалерея
Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

17:13
Мыло и верёвку подарила министру пенсионерка Новосибирска на сумму надбавки
15:08
Резидентам ИТМО Хайпарк раздают землю на форуме "Открытые инновации"
09:10
Студент из Луганска представил республику в международном проекте
08:55
Олимпийская команда России завоевала рекордное количество медалей на ЮОИ - 2018
17:42
Путин заявил условия применения Россией ядерного оружия‍
13:32
Список погибших при нападении на колледж в Керчи опубликовали власти Крыма
12:42
Восемь самых популярных автомобилей иномарок в Петербурге
10:27
Хоккеисты "Динамо Санкт-Петербург" встретили на своей площадке «Торпедо» (Усть-Каменогорск)
20:04
Евкуров: Уходить с поста главы Ингушетии "под давлением" не намерен
15:39
Взрыв в колледже Керчи. СК России возбудил уголовное дело по статье теракт
14:42
Реклама в новостройках Санкт-Петербурга
12:34
Сбербанк начал менять бонусы "Спасибо" на рубли
10:26
Спортсмены России завоевали 4 медали в десятый день Юношеских Олимпийских Игр
18:10
Трехмиллионному туристу предложат конину и чак-чак в Казани
16:16
Митрополит УПЦ объявил себя клириком Константинополя‍ автоматически
13:05
В команде ВХЛ «Динамо Санкт-Петербург» назначили нового тренера
12:08
Три уголовных дела возбудил СК России после новых обстрелов Донбасса
10:15
Новые ценные бумаги вводят в обращение в России
18:47
Неделя донора стартовала в Луганском университете им. Тараса Шевченко
17:20
Дивизионы комплексов "Бастион" и "Бал" подняты по тревоге в Крыму
Больше новостей