Promo

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru / Биоинформатики Санкт-Петербургского госуниверситета создали новый алгоритм для анализа метагеномов — наборов геномов больших сообществ микроорганизмов. Такие организмы, например, обитают в почве, воде, а также в кишечниках животных и человека. Новый подход позволил выяснить, что в настоящее время медики знают лишь о половине кишечных бактерий, которые живут в организмах людей. Результаты исследования уже опубликованы в журнале Cell Systems.

Биоинформатики восстанавливают последовательность генома, так как в нем заложены данные о наследственных особенностях живого организма. Для выявления информации специалисты секвенируют («разрезают» молекулы ДНК на мелкие «кусочки», а затем прочитывают каждый из них). Затем геном восстанавливают (собирают) из фрагментов, называемых ридами.

В настоящее время ученые умеют работать как с единственным геномом, так и с их совокупностями, называемыми метагеномами. Это может быть генетический материал большого сообщества бактерий, которое живет в почве, в воде океанов, в сточных водах, а также в кишечнике человека. Новый алгоритм, который разработали младший научный сотрудник СПбГУ Антон Банкевич и завлабораторией «Центр алгоритмической биотехнологии» Института трансляционной биомедицины СПбГУ Павел Певзнер, позволяет гораздо эффективнее исследовать именно такой генетический материал.

Исследователи СПбГУ первыми в мире начали изучать редкие бактерии с помощью анализа результатов секвенирования сразу двух технологий: Illumina, для получения коротких фрагментов ДНК, и TruSeq Synthetic Long Reads (TSLR) для восстановления длинных участков генома. Биоинформатики с помощью различных математических методов находят участки ДНК (как короткие, так и длинные).

Антон Банкевич сообщил, что расчеты показали - суммарная длина геномов бактерий в кишечнике человека равна 1,3 миллиарда нуклеотидов, а исследователи восстановили лишь только 656 миллионов. Вывод - ученые знают только половину микроорганизмов, которые живут в кишечнике (животе) человека. Он также отметил, что новые бактерии могут обладать интересными свойствами и помогут создавать новые виды антибиотиков, пестицидов, помочь создать устойчивые к болезням овощей и фруктов. Исследования помогут выявить различные заболеваниях желудочно-кишечного тракта.
фото: архив logicno.com

Добавляйте наше издание, нажав на "Мои источники", и вы всегда будете видеть свежие новости от Absolut TV в сервисе Яндекс Новости и в Google News Подписывайтесь на канал ABSOLUT TV Дзен Яндекс
Фотогалерея
Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

17:01
Возврат Навального: Во Внуково хотят запретить массовые мероприятия и съёмку СМИ
13:44
"Союзмультфильм": Чебурашка останется символом олимпийского движения в России
12:42
Цены на мобильную связь в России вырастут
19:13
Торговым сетям Петербурга и Ленобласти предложили тоже заморозить цены
16:24
Какую новую боевую технику получит в 2021 году армия России
15:06
Мишустин: Наступает переломный момент кризиса, связанном с COVID-19
10:17
Собянин: Ученики Москвы вернутся в школы в январе
17:23
Microsoft получила патент на метод «цифровая реинкарнация» людей
15:37
Володин: Парламентские партии имеют все шансы пройти в следующую Думу
13:36
Славянский календарь на 2021 (7530) год. Что нас ожидает?
18:45
Прототип электрокара Vision-S показала видео испытаний компания Sony
17:25
Переговоры по Донбассу в нормандском формате начались в ФРГ
14:24
Новых обладателей «золотых паспортов» из России назвали в Мальте
19:51
Экипажи "Камаз-мастер" вновь заняли первые три места в ралли "Дакар"
17:49
Новый вид диагностики рака печени придумали учёные. Точно выясняется тип опухоли
17:31
Мусорная «печать» Невского района: кто виноват в сложившейся ситуации?
16:29
Какие ограничения будут действовать в Петербурге до конца января 2021
13:06
Застройщики смогут получать кредиты под 3%, но с условием
18:53
Причины крушения самолета Boeing 737-524 в Индонезии определили специалисты
15:04
Сборная России сенсационно выиграла смешанную эстафету в Кубке мира по биатлону
Больше новостей