Jaguar

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru / Биоинформатики Санкт-Петербургского госуниверситета создали новый алгоритм для анализа метагеномов — наборов геномов больших сообществ микроорганизмов. Такие организмы, например, обитают в почве, воде, а также в кишечниках животных и человека. Новый подход позволил выяснить, что в настоящее время медики знают лишь о половине кишечных бактерий, которые живут в организмах людей. Результаты исследования уже опубликованы в журнале Cell Systems.

Биоинформатики восстанавливают последовательность генома, так как в нем заложены данные о наследственных особенностях живого организма. Для выявления информации специалисты секвенируют («разрезают» молекулы ДНК на мелкие «кусочки», а затем прочитывают каждый из них). Затем геном восстанавливают (собирают) из фрагментов, называемых ридами.

В настоящее время ученые умеют работать как с единственным геномом, так и с их совокупностями, называемыми метагеномами. Это может быть генетический материал большого сообщества бактерий, которое живет в почве, в воде океанов, в сточных водах, а также в кишечнике человека. Новый алгоритм, который разработали младший научный сотрудник СПбГУ Антон Банкевич и завлабораторией «Центр алгоритмической биотехнологии» Института трансляционной биомедицины СПбГУ Павел Певзнер, позволяет гораздо эффективнее исследовать именно такой генетический материал.

Исследователи СПбГУ первыми в мире начали изучать редкие бактерии с помощью анализа результатов секвенирования сразу двух технологий: Illumina, для получения коротких фрагментов ДНК, и TruSeq Synthetic Long Reads (TSLR) для восстановления длинных участков генома. Биоинформатики с помощью различных математических методов находят участки ДНК (как короткие, так и длинные).

Антон Банкевич сообщил, что расчеты показали - суммарная длина геномов бактерий в кишечнике человека равна 1,3 миллиарда нуклеотидов, а исследователи восстановили лишь только 656 миллионов. Вывод - ученые знают только половину микроорганизмов, которые живут в кишечнике (животе) человека. Он также отметил, что новые бактерии могут обладать интересными свойствами и помогут создавать новые виды антибиотиков, пестицидов, помочь создать устойчивые к болезням овощей и фруктов. Исследования помогут выявить различные заболеваниях желудочно-кишечного тракта.
фото: архив logicno.com

Добавляйте наше издание, нажав на "Мои источники", и вы всегда будете видеть свежие новости от Absolut TV в сервисе Яндекс Новости и в Google News Подписывайтесь на канал ABSOLUT TV Дзен Яндекс
Фотогалерея
Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

комментариев

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

12:13
Мобильные операторы связи заявили даты отмены роуминга по России
10:09
Водка разной крепости теперь в России будет стоить одинаково
21:27
"Зенит" разгромил "Урал" в чемпионате России. Эта победа стала четвертой в турнире
20:56
Модернизированный Ми-26Т2В выполнил первый полет
22:18
Кинофестиваль "Короче" начал свою работу в Калининграде
11:39
Цифровые технологии на выборах обсудит первый конгресс наблюдателей
08:49
"Зенит" разгромил "Динамо" и вышел в плей-офф квалификации Лиги Европы
19:11
Путин и Пашинян обсудили двусторонние отношения России и Армении
18:34
Сборная России резко подняла свой рейтинг в ФИФА (FIFA)
16:12
Молодые предприниматели Петербурга могут бесплатно зарегистрировать свое предприятие
15:16
Ученые СПбГУ синтезировали спирали железа тоньше волоса человека
14:14
Новый бомбардировщик-ракетоносец Ту-22М3М показали в Казани
09:34
Авиабилеты дорожают, туристы массово скупают популярные маршруты
20:11
Чай вреден для здоровья, заявили эксперты
14:32
«Алроса» продала впервые за рубли крупнейший бриллиант «Династия» иностранцам
10:29
"Спартак" сыграл с ПАОКом и покинул Лигу чемпионов
09:28
Законопроект об усилении санкций против РФ опубликован на сайте Конгресса США
16:50
Денис Четырбок дал комментарий по выходке людей, пытавшихся разжечь мангал на Медном всаднике
15:32
Эрдоган: Турция объявляет бойкот электронной продукции из США
13:55
"Зенит" победил "Рубин" в матче ЧР по футболу
Больше новостей