jaguar

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru / Биоинформатики Санкт-Петербургского госуниверситета создали новый алгоритм для анализа метагеномов — наборов геномов больших сообществ микроорганизмов. Такие организмы, например, обитают в почве, воде, а также в кишечниках животных и человека. Новый подход позволил выяснить, что в настоящее время медики знают лишь о половине кишечных бактерий, которые живут в организмах людей. Результаты исследования уже опубликованы в журнале Cell Systems.

Биоинформатики восстанавливают последовательность генома, так как в нем заложены данные о наследственных особенностях живого организма. Для выявления информации специалисты секвенируют («разрезают» молекулы ДНК на мелкие «кусочки», а затем прочитывают каждый из них). Затем геном восстанавливают (собирают) из фрагментов, называемых ридами.

В настоящее время ученые умеют работать как с единственным геномом, так и с их совокупностями, называемыми метагеномами. Это может быть генетический материал большого сообщества бактерий, которое живет в почве, в воде океанов, в сточных водах, а также в кишечнике человека. Новый алгоритм, который разработали младший научный сотрудник СПбГУ Антон Банкевич и завлабораторией «Центр алгоритмической биотехнологии» Института трансляционной биомедицины СПбГУ Павел Певзнер, позволяет гораздо эффективнее исследовать именно такой генетический материал.

Исследователи СПбГУ первыми в мире начали изучать редкие бактерии с помощью анализа результатов секвенирования сразу двух технологий: Illumina, для получения коротких фрагментов ДНК, и TruSeq Synthetic Long Reads (TSLR) для восстановления длинных участков генома. Биоинформатики с помощью различных математических методов находят участки ДНК (как короткие, так и длинные).

Антон Банкевич сообщил, что расчеты показали - суммарная длина геномов бактерий в кишечнике человека равна 1,3 миллиарда нуклеотидов, а исследователи восстановили лишь только 656 миллионов. Вывод - ученые знают только половину микроорганизмов, которые живут в кишечнике (животе) человека. Он также отметил, что новые бактерии могут обладать интересными свойствами и помогут создавать новые виды антибиотиков, пестицидов, помочь создать устойчивые к болезням овощей и фруктов. Исследования помогут выявить различные заболеваниях желудочно-кишечного тракта.
фото: архив logicno.com

Добавляйте наше издание, нажав на "Мои источники", и вы всегда будете видеть свежие новости от Absolut TV в сервисе Яндекс Новости и в Google News Подписывайтесь на канал ABSOLUT TV Дзен Яндекс
Фотогалерея
Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий
BMW
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

ПОДДЕРЖИТЕ ПРОЕКТ ABSOLUT TV

Вы можете перечислить любую сумму

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

19:41
Биатлонистка Халиуллина победила в индивидуальной гонке юниорского Чемпионата мира
17:32
Онищенко: Препараты, способные победить новый коронавирус, есть
15:19
Жителей Петербурга в возрасте 50+ обучат бесплатно
15:05
«Русский дом» в Давосе: Три года успешной работы
10:38
Из-за сообщения о бомбе российский пассажирский самолет готовится к посадке
16:08
Почему египтяне не хотят видеть у себя туристов из России
15:01
Короновирус усилил способность перехода от человека к человеку, заявили в Китае
12:49
Граждане пришли к Администрации президента и требуют референдум по поправкам в Конституцию РФ
00:57
Российские фигуристки заняли весь пьедестал на чемпионате Европы 2020
19:22
Фигуристы Синицина и Кацалапов завоевали золото Чемпионата Европы 2020 в танцах на льду
00:34
Фигуристы России заняли весь пьедестал на ЧЕ 2020 в спортивных парах
18:57
Фигуристки России выиграли короткую программу на Чемпионате Европы 2020
17:39
В ФРГ неизвестный открыл огонь, есть погибшие
13:05
Общественная экспертиза законопроекта о поправках Конституции пройдет 29 января
12:26
РБК: Новый вид супермаркетов появится в России уже в этом году
11:19
Роскачество пояснил насколько опасен диоксид серы в винах
19:56
В честь Высоцкого Императорский фарфоровый завод выпускает уникальные изделия
17:25
Зимние юношеские Олимпийские игры 2020 завершились. Первое место заняла сборная России
17:07
General Motors создала свой беспилотный электрический микроавтобус. ВИДЕО
13:20
Госдума приняла в 1-ом чтении законопроект о внесении изменений в Конституцию РФ
Больше новостей
Новая охта