utair

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий

Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru / Биоинформатики Санкт-Петербургского госуниверситета создали новый алгоритм для анализа метагеномов — наборов геномов больших сообществ микроорганизмов. Такие организмы, например, обитают в почве, воде, а также в кишечниках животных и человека. Новый подход позволил выяснить, что в настоящее время медики знают лишь о половине кишечных бактерий, которые живут в организмах людей. Результаты исследования уже опубликованы в журнале Cell Systems.

Биоинформатики восстанавливают последовательность генома, так как в нем заложены данные о наследственных особенностях живого организма. Для выявления информации специалисты секвенируют («разрезают» молекулы ДНК на мелкие «кусочки», а затем прочитывают каждый из них). Затем геном восстанавливают (собирают) из фрагментов, называемых ридами.

В настоящее время ученые умеют работать как с единственным геномом, так и с их совокупностями, называемыми метагеномами. Это может быть генетический материал большого сообщества бактерий, которое живет в почве, в воде океанов, в сточных водах, а также в кишечнике человека. Новый алгоритм, который разработали младший научный сотрудник СПбГУ Антон Банкевич и завлабораторией «Центр алгоритмической биотехнологии» Института трансляционной биомедицины СПбГУ Павел Певзнер, позволяет гораздо эффективнее исследовать именно такой генетический материал.

Исследователи СПбГУ первыми в мире начали изучать редкие бактерии с помощью анализа результатов секвенирования сразу двух технологий: Illumina, для получения коротких фрагментов ДНК, и TruSeq Synthetic Long Reads (TSLR) для восстановления длинных участков генома. Биоинформатики с помощью различных математических методов находят участки ДНК (как короткие, так и длинные).

Антон Банкевич сообщил, что расчеты показали - суммарная длина геномов бактерий в кишечнике человека равна 1,3 миллиарда нуклеотидов, а исследователи восстановили лишь только 656 миллионов. Вывод - ученые знают только половину микроорганизмов, которые живут в кишечнике (животе) человека. Он также отметил, что новые бактерии могут обладать интересными свойствами и помогут создавать новые виды антибиотиков, пестицидов, помочь создать устойчивые к болезням овощей и фруктов. Исследования помогут выявить различные заболеваниях желудочно-кишечного тракта.
фото: архив logicno.com

Добавляйте наше издание, нажав на "Мои источники", и вы всегда будете видеть свежие новости от Absolut TV в сервисе Яндекс Новости и в Google News Подписывайтесь на канал ABSOLUT TV Дзен Яндекс
Фотогалерея
Ученые СПбГУ выяснили, что в кишечнике человека изучена только половина бактерий
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

10:40
Названы регионы России с самым высоким качеством жизни
10:03
О наших союзниках-патриотах в годы Великой Отечественной войны 1941-1945 гг
19:32
Орешкин объявил когда рубль будет устойчивым в соотношении с ценой на нефть
18:01
Лучший охотничий нож определили на конкурсе кузнецов «Дархан Уус – 2019» в Якутии
11:48
Конкурс «Лучший кухонный нож" на выставке кузнецов Якутии «Дархан Уус - 2019» выиграл Семен Охлопков
11:28
Новая экипировка "Ратник -3" будет иметь сверхлегкий беспилотник
10:06
Жители Гаити выступают против США и зовут на помощь Россию
21:25
Bentley сообщил о самом быстром в мире внедорожнике (ВИДЕО)
20:20
Дина Аверина выиграла в многоборье на этапе Гран-при по художественной гимнастике
20:24
К 50-летию подразделений ЛРР Росгвардии прошли праздничные мероприятия в Петербурге
19:39
Запретить экспорт фанерного кряжа предложили лесопромышленники Коми
14:07
Участвовать в распределении бюджета смогут жители Санкт-Петербурга
11:35
Куда поедут туристы из России на 23 февраля и 8 марта
10:20
Супербактерия - золотистый стафилококк. Как с ней бороться?
18:28
Volkswagen Tiguan в новой комплектации появится в России
16:27
СКА победил "Спартак" в матче регулярного чемпионата КХЛ
14:43
PROКОСМОС «Межпланетные путешествия» откроется в Санкт-Петербурге
13:01
Закон о митингах подвергнут демократизации в Санкт-Петербурге
10:32
Экспорт российского леса могут запретить власти РФ
19:44
В Госдуме РФ приняли решение по повышению МРОТ
Больше новостей