Promo

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

18:39
Лыжницы сборной России завоевали серебро в эстафете на чемпионате мира
16:49
Авиабилеты станут дороже в 1,5 или 2 раза
11:29
Пробки, свалки, перекрытие вида: избежать проблем с будущим жильем возможно
17:03
Сокрушительная победа в поединке с Оверимом: Драго намерен получить звание чемпиона UFС
обновлено
13:48
В Петербурге 11 муниципальных депутатов лишатся своих полномочий
11:37
Военным ДНР разрешили открывать огонь для подавления позиций вооруженных сил Украины
10:58
Мошенники работают активно по схеме с "ошибочным" переводом денег
18:52
Ленобласть потребовала от РЖД отремонтировать 60 переездов
18:22
Сноубордистка София Надыршина победила в параллельном слаломе на чемпионате мира
15:22
Санкции США против РФ из-за Навального будут такими же, как и меры от ЕС
17:46
ФАС оштрафовала "Яндекс" за ненадлежащую рекламу финансовых услуг компаний
12:03
В Донецке 26 школ «заминировали» неизвестные
11:42
Володин: Обещания депутатов избирателям перед выборами надо фиксировать
16:59
Большунов и Ретивых заняли 3-е место в командном спринте на чемпионате мира
15:50
Разведка у границ РФ. Около 40 самолетов и беспилотников других стран обнаружили РЛС России
13:51
Прививка от коронавируса унесла жизни 16 человек в Швейцарии
17:23
Гены помогут определить, кому грозит язва желудка
обновлено
16:58
Большунов стал чемпионом мира в гонке в Оберстдорфе, опередив пятерых норвежцев
18:21
Турция меняет условия въезда для туристов. Когда это произойдёт?
17:31
Конфликт со стрельбой и жертвами произошел в кафе Ленобласти
Больше новостей
Новая охта