jaguar

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
BMW
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

20:42
КамАЗы из России заняли весь подиум "Шелкового пути" в зачете грузовиков
20:08
Алмаз, крупнейший в Европе, нашли в Архангельской области
17:25
Худеть с витамином D - самый верный способ, уверены ученые
15:09
Муниципальные выборы в Ленинградской области. Конкуренция - 116%
10:58
Реклама в новостройках Санкт-Петербурга
10:53
Лучшие антивирусы для Windows и Mac объявило Роскачество
19:54
Кино о Т-34 – ремикс советского фильма «Жаворонок»
18:23
Росгвардия обеспечила правопорядок на IX Международном военно-морском салоне IMDS-2019 в Петербурге
17:56
Кому передадут деньги из Фонда национального благосостояния?
09:32
Волейболисты сборной России победили команду США в финале Лиги наций
20:32
Новые тракторы "Кировец К-7" начали выпускать в Петербурге
17:20
Кандидат в губернаторы от КПРФ Бортко призвал оставить Беглова одного в бюллетене
12:10
Волейболисты России вышли в финал Лиги наций. Уже известен соперник
17:16
Единственное жилье заберут при задолженности по ЖКХ
13:18
Visa и MasterCard. В Госдуме и Минфине объяснили вариант ухода из России платёжных систем
00:22
Волейболистки России завоевали золото Универсиады 2019, обыграв в финале команду Италии
13:25
Россия предложила Индии ввести безвизовый режим для туристических групп
11:19
СКР возбудил уголовное дело в отношении главы Нижнеудинского района Худоногова
10:42
«Метрострой» впервые показал новую станцию «Проспект Славы», открытие через 1,5 месяца
07:55
Странная смерть федерального судьи Татьяны Секериной в центре Волгограда
Больше новостей
Новая охта