Promo

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
BMW
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

13:47
Доклад об утечке COVID-19 из лаборатории Китая опубликовали в США
12:09
Как жить с заболеваниями суставов? Советы дают специалисты
18:35
Сборная России завоевала 7 медалей на Олимпиаде в Токио 1 августа
18:02
Павлюченкова и Рублев взяли золото Олимпиады в теннисном миксте
13:52
КПРФ внесла жалобу в Верховный суд РФ по снятию Грудинина с выборов
12:26
Апокалипсис может начаться скоро. Предсказания святых о России и мире
22:14
Россия завоевала золото, серебро, бронзу Олимпиады в Токио 31 июля
19:52
Набиуллина предрекла долгосрочную инфляцию в России
20:35
Виноделы просят сделать переходный период из-за нового закона
обновлено
12:53
Сборная России завоевала золото и серебро Олимпиады в Токио 30 июля
обновлено
21:14
Росрыболовство подало иск к «Норникелю» из-за гибели рыбы на миллиарды
обновлено
16:25
Росгвардейцы Петербурга приняли участие в учениях «Заслон - 2021»
14:44
Авиакомпания "Россия" скоро начнёт полёты на курорты Египта
21:16
Сборная России завоевала пять медалей на Олимпийских играх в Токио
20:40
В России дорожают гречка, капуста и яблоки
18:16
КПРФ организует свои видеотрансляции с избирательных участков
13:44
Баскетболистки России (3х3) сыграют в финале Олимпиады в Токио
16:09
Гимнастки России завоевали золото на Олимпиаде в Токио в команде
15:51
Пловцы и стрелки России завоевали медали на Олимпиаде в Токио
13:54
Женщина поймала мальчика, который выпал из окна в Новокузнецке
Больше новостей
Новая охта