Promo

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

11:28
Синхронистки Ромашина и Колесниченко из России победили в произвольной программе на ЧЕ
18:17
Опасные инфекции, переносимые москитами, нейтрализуют вакцинами, заявили ученые
13:53
Присоединение Донбасса к России невозможно, считает Песков
11:24
Новая ракета Китая поставит под сомнение стратегическое превосходство США и России?
21:56
Сборная России выиграла у команды Швеции в 1-ом матче Чешских хоккейных игр
21:24
Суд в Казани арестовал обвиняемого в нападении на школу №175
18:17
Harley-Davidson вновь стал выпускать электрические мотоциклы LiveWire
14:37
Туристам из России скоро откроют много стран: Италия, Мальта, Португалия, Израиль, Тунис и другие
13:06
Мишустин отметил, что Петербург обеспечивает антивирусными препаратами всю страну
обновлено
22:07
Черчесов объяснил включение Захаряна в расширенный состав сборной России на Евро
18:50
Госдума РФ обсудит запрет причастным к экстремистским организациям избираться депутатами
11:16
Стрельба в школе Казани. Есть погибшие и пострадавшие
10:11
Новый крупный ретейлер с большой сетью супермаркетов появился в России, сообщает РБК
18:02
Новый мировой экономический кризис грянет скоро. Прогнозы для России и всего Мира
обновлено
14:23
Молодежь Латвии выложила ночью ковер из цветов возле памятника советским освободителям Риги в войне 1941-1945 гг
12:26
Министра Мураховского нашли живым. Глава Минздрава Омска пропал ранее на охоте
11:56
Нина Зарина из России победила в самом массовом забеге в Wings for Life World Run
11:23
Финляндия планирует запустить скоростной поезд «Аллегро» на время ЕВРО-2020
13:17
День Победы СССР в Великой Отечественной войне отмечают 9 мая в России
обновлено
23:36
Как проводит свободное время московская молодежь: рейтинг самых популярных вариантов
обновлено
Больше новостей
Новая охта