Медиапроект Новая Россия

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

комментариев

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

12:22
Госдума РФ: Экстремисты не могут быть учредителями или редакторами СМИ
11:30
Завод Nissan в Санкт-Петербурге хотят банкротить
19:37
Ильиных и Полякова вышли в финал ЧМ-2017 по прыжкам в воду
16:00
Разведка ДНР: Под Донецк и Горловку ВСУ перебросили 13 танков
13:56
КПРФ зарегистрировала 260 кандидатов на муниципальных выборах в Москве
12:16
Россия вошла в ТОП-5 как худшая страна для проживания пенсионеров
11:23
До 1 трлн руб. долгов перед банками могут списать с россиян
20:56
Спиннер - вред или польза для молодого поколения
20:02
Синхронистка Колесниченко выиграла золото в произвольной программе солисток на ЧМ-2017
14:28
Фестиваль бардовской песни «Гринландия» пройдёт в Кирове
13:25
Михалков и Кончаловский планируют открыть свой фастфуд в 2017 году
09:43
Партии будут согласовывать губернаторов с администрацией президента РФ
20:33
Синхронистки России завоевали золото ЧМ в группе
17:37
Александр Дрозденко против мусорных гор
15:07
Туроператор «Аэлита Трэвел» приостановил деятельность, туристам обращаться в офисы
14:02
"Победа" начнет выполнять рейсы из Москвы в Санкт-Петербург
11:34
В ДНР объявили о создании государства Малороссия вместо Украины
21:00
Рыба-мутант кусала отдыхающих на озере в Томской области
18:56
Обновлённый «Зенит» провел первую игру нового сезона 2017/18 в РФПЛ
16:21
Жители ДНР вспомнили жертв крушения Boeing и призвали Киев к ответу
Больше новостей