Медиапроект Новая Россия

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

комментариев

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

21:20
Полуфинал St.Petersburg Open -2017. Великолепная четверка определена
20:46
Учитель года России определится в очных турах конкурса в Сочи
15:27
Сыр разных видов по старинным рецептам представят в Карачаево-Черкесии
13:51
Более 70 национальностей представят свою культуру на фестивале в Сальске
11:28
Симферополь возглавил Игорь Лукашев
10:57
В Калмыкии социальные проекты представят на образовательном форуме "Уралан"
09:40
1155 лет зарождения государственности России отметили в Великом Новгороде
20:56
St. Petersburg Open 2017. Южный проигрывает Фоньини, но борьбу продолжает
18:11
Суперкубок детского дворового футбола "Метрошка-2017" открылся в Челябинске
17:26
Юха Сипиля: Финляндия и Россия оживляют торговые отношения
15:47
Межрегиональная авиация создаёт условия для развития экономики, считают во Владимире
12:59
Украинские военные за сутки более 30 раз нарушили режим тишины
11:23
Вологодское кружево представили в Берлине
10:02
Мордовия активно увеличивает объёмы торговли с другими странами
19:27
Медведев – Фаббиано. Триллер под названием "Теннис" на St. Petersburg Open 2017
18:22
Музей "Аркаим" под Челябинском подготовят для туристов архитекторы из Москвы
16:49
Специалистов, нужных для предприятий, будут готовить училища в Алтайском крае
15:35
С праздником, Петербург – Петергоф!
14:53
Генетики Уфы по ДНК начали определять будущих чемпионов в спорте
12:17
Депутаты ЗакСа предложили штрафовать чиновников за воспрепятствование их деятельности
Больше новостей