Jaguar

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

комментариев

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

14:16
Хоккеисты России вышли в финал Олимпиады 2018, обыграв команду Чехии
13:13
В Луганске открыли памятник добровольцам России
11:12
Фигуристка Алия Загитова завоевала золото Олимпиады, Евгения Медведева - серебро
21:20
Реклама в новостройках Санкт-Петербурга
21:19
Олимпиада-2018. Пхёнчан. Расписание соревнований. Медальный зачет
19:58
Даты проведения Всероссийских спортивных соревнований стали известны
18:36
Украина завершила АТО в Донбассе. Что дальше ждёт ДНР и ЛНР?
15:04
Техосмотр автомобилей стал жестче в России с 22 февраля
13:56
Лев Толстой. Мудро о благотворительности
11:39
В Петербурге открылось уникальное Sound-Cafe с инновационным подходом
10:49
«Мусорные» вопросы продолжают беспокоить жителей Петербурга
13:13
Хоккеисты России разгромили команду Норвегии и вышли в полуфинал Олимпиады 2018
12:21
Комитет в Смольном возглавит бывший топ-менеджер компании «Аэрофлот»
10:09
Алина Загитова с мировым рекордом лидирует после короткой программы на Олимпиаде
09:15
Фристайлист Сергей Ридзик завоевал бронзу Олимпиады в ски-кроссе для сборной России
16:05
Смартфон Onkyo DP-CMX1 - гаджет для настоящих меломанов
14:03
Учителя вышли на пикет из-за отмены льгот в Курганской области
12:06
Угон иномарок от новостроек Ленобласти стал традицией
09:59
ЦБ РФ отозвал лицензию у банка "Мастер-Капитал"
17:16
Скверы и парки Санкт-Петербурга под угрозой
Больше новостей