utair

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

20:03
Муниципальный фильтр на выборах согласилась снизить партия "Единая Россия"
17:33
Новостройки Санкт-Петербурга. Цены упали значительно
12:39
Citroen показала сверхкомпактный городской электромобиль Ami One Concept (ВИДЕО)
09:52
Лучшие в мире смартфоны. Назван ТОП 20
19:24
Состав сборной России по биатлону на чемпионат Европы уже известен
16:22
Взрывы в Донецке. В центре города были взорваны несколько бомб
15:20
Названы регионы России с самым высоким качеством жизни
10:03
О наших союзниках-патриотах в годы Великой Отечественной войны 1941-1945 гг
19:32
Орешкин объявил когда рубль будет устойчивым в соотношении с ценой на нефть
18:01
Лучший охотничий нож определили на конкурсе кузнецов «Дархан Уус – 2019» в Якутии
11:48
Конкурс «Лучший кухонный нож" на выставке кузнецов Якутии «Дархан Уус - 2019» выиграл Семен Охлопков
11:28
Новая экипировка "Ратник -3" будет иметь сверхлегкий беспилотник
10:06
Жители Гаити выступают против США и зовут на помощь Россию
21:25
Bentley сообщил о самом быстром в мире внедорожнике (ВИДЕО)
20:20
Дина Аверина выиграла в многоборье на этапе Гран-при по художественной гимнастике
20:24
К 50-летию подразделений ЛРР Росгвардии прошли праздничные мероприятия в Петербурге
19:39
Запретить экспорт фанерного кряжа предложили лесопромышленники Коми
14:07
Участвовать в распределении бюджета смогут жители Санкт-Петербурга
11:35
Куда поедут туристы из России на 23 февраля и 8 марта
10:20
Супербактерия - золотистый стафилококк. Как с ней бороться?
Больше новостей