jaguar

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
TK-Lanskoy
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

19:08
Граждане Италии сократили ненужных депутатов на 30%. В России предлагали подобную инициативу
18:01
Фильм Данилы Козловского "Чернобыль" покажут в других странах
15:17
Органический мусор в корм для животных будут перерабатывать в РФ
21:32
СКА победил «Торпедо», отразив десятки шайб
19:13
Россия возобновляет авиасообщение еще с несколькими странами
15:18
Бронированную технику и водометы подтянули к резиденции Лукашенко
13:58
Умер ведущий игры "Русское лото" Михаил Борисов. Госпитализация со съёмочной площадки
12:54
Хамзат Чимаев выиграл бой за 17 секунд и установил рекорд UFC
18:26
Решение по матчу "Ростов" - "Ротор" будет принято 22 сентября
16:58
Росконгресс и Федерация бобслея России подписали договор о сотрудничестве
13:52
Банк России оставил ключевую ставку 4,25%
20:42
Белоруссия закрывает свою границу с Украиной, Польшей, Литвой
17:31
Ураган "Айла" подойдёт к Петербургу ночью
14:07
Федеральный центр мозга и нейротехнологий ФМБА России окажет бесплатно помощь пациентам
12:20
На учениях "Славянское братство" российские десантники России и Белоруссии форсировали реку
20:20
Минфин РФ будет пополнять и тратить средства ФНБ в следующем году
15:57
Фигуристка Евгения Медведева ушла от канадского тренера
18:13
Госдума РФ примет более 30 налоговых законов осенью
16:10
Станет ли курортом самая большая свалка Санкт-Петербурга?
16:02
Аэропорт Шереметьево и авиакомпания «Россия» представили новейший ангарный комплекс
Больше новостей
Новая охта