utair

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

Новости партнеров

комментарии

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

11:30
Продукты местного производства будут покупать из дома в Якутии
20:45
Крупный пожар в Кемерово. Горит автосалон Hyundai. ВИДЕО
19:24
Сбербанк сообщил, как защититься от мошенничества через терминалы
14:54
Греф: Олигархов отстраняют от власти в России
06:12
Скандально известный депутат Резник обвинил журналистов в обмане мошенниками жены
18:37
Сборная России по художественной гимнастике завоевала все золото на ЧЕ-2019. ВИДЕО
17:36
Взрыв в Каире. В туристическом автобусе пострадали иностранцы
16:05
Новый кроссовер Aurus Komendant. Первые фото в Интернете. ВИДЕО
13:12
Туберкулез. До 30% россиян заражены. Как защититься?
09:54
Сергей Лазарев: На Евровидении было предвзятое отношение к России ВИДЕО
18:43
Россия увеличивает запас золота и демпингует доллар
15:49
Сборная России выиграла у команды Латвии и досрочно вышла в четвертьфинал ЧМ по хоккею
09:41
Баскетболисты ЦСКА выиграли у команды "Реал" (Мадрид) и вышли в финал Евролиги
08:57
Пассивный доход. Предлагаем самый простой способ
22:54
Google предсказал победителей конкурса "Евровидение 2019"
21:27
Одиозный депутат Резник вымогал деньги у застройщиков, прикрываясь защитой памятников
16:11
Олимпийская чемпионка по биатлону Дальмайер завершила карьеру
15:47
Четыре вида инопланетян постепенно заселяют Землю, утверждает профессор Янг Хэ Чи
13:51
Трудовые книжки россиян оцифровали в Пенсионном фонде
09:57
Студенты Луганского университета покоряют индустрию красоты
Больше новостей