Медиапроект Новая Россия

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products

Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Санкт-Петербург / AbsolutTV.ru Международная группа ученых-биоинформатиков разработала программу Dereplicator, которая позволяет упростить и ускорить поиск продуктов жизнедеятельности бактерий, которые являются потенциальными антибиотиками, противоопухолевыми или противовирусными препаратами. Об этом сообщает пресс-служба СПбГУ.
Активное участие в этой работе приняли младшие научные сотрудники СПбГУ Алексей Гуревич и Алла Михеенко. Разработка инструмента проводилась и на базе лаборатории «Центр алгоритмической биотехнологии» СПбГУ, которой руководит Павел Певзнер.

Что такое программа Dereplicator?

Программа Dereplicator позволяет ученым сравнивать имеющиеся базы химических структур продуктов жизнедеятельности микроорганизмов (Natural Products) с входными данными в виде масс-спектров тех веществ, которые интересуют исследователя в данный момент. Инструмент определяет, какие химические соединения из новых входных данных уже содержатся в базе известных Natural Products.
Таким образом,  в разы уменьшается объем поиска тех веществ, которые потенциально могут стать новыми антибиотиками. Сегодня разработка новых антибактериальных препаратов является одной из приоритетных задач современной науки.

Уникальность программы Dereplicator

Уникальность нового программного продукта - обработка более сложных структур — циклических и разветвленных. Ученым СПбГУ удалось усовершенствовать программу и сделать ее доступной для широкого круга пользователей.
Была разработана веб-версия продукта, которой могут пользоваться ученые всего мира, для этого им необходимо лишь зарегистрироваться на платформе GNPS.
Биоинформатики Санкт-Петербургского университета также значительно увеличили скорость работы инструмента. Если в сентябре 2015 года запуск первой версии программы платформе GNPS занимал неделю, то сегодня программа Dereplicator способна обработать такое же количество данных за 4 часа.
фото: архив mitochondrialdiseasenews.com
Фотогалерея
Ученые СПбГУ открыли способ поиска новых антибиотиков с Natural Products
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь. Мы рекомендуем Вам зарегистрироваться либо зайти на сайт под своим именем.

комментариев

Ваше имя: *
Ваш e-mail: *

Подписаться на комментарии

Код: Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Введите код:

Свежие новости

18:07
Претензии от граждан по акции 26 марта ждёт Общественный совет при МВД по Петербургу
09:51
Сборная России в овертайме проиграла шведам в матче Еврохоккейтура
09:14
Проблему Карабаха обсудят главы МИД РФ, Армении и Азербайджана
18:46
Выбираем национальную идею России
18:45
Ледокол «Красин» примет на борт Форум арктических музеев
16:55
Греция, Испания, Чехия – лидеры турпотока на майские праздники
14:27
Гуманитарный конвой МЧС РФ прибыл в Донецк, по счету - 64-й
12:26
Борис Титов: помогите бизнесу, и он поможет стране
09:44
Глава Хакасии отправил правительство республики в отставку
21:12
"Зенит" обыграл "Оренбург" в матче 25 тура чемпионата России
18:54
За возможную отставку Медведева высказались почти 50% респондентов опроса
15:17
Леспром в России нуждается в новых подходах к работе
12:19
Губернатор Полтавченко отчитывается перед ЗакСом Петербурга
10:54
По делу о педофилии в детском доме Петербурга арестовали 5 человек
09:12
Реклама в новостройках Санкт-Петербурга
22:00
"Спартак" выиграл у команды "Урал" в 25-м туре Чемпионата России
13:15
"Народные облигации" ОФЗ начнет продавать Минфин 26 апреля
11:48
Тюрьму до 7 лет предложила чиновникам за незаконное обогащение СР
10:37
ОМОН и полиция проверяют тщательно турецкую компанию в Петербурге
20:20
ВСУ за сутки 28 раз массированно обстреляли территорию ДНР
Больше новостей